Σε ένδειξη τιμής και αναγνώρισης της προσφοράς της Έφης Μιχελή το Ίδρυμα Μιχελή έχει διοργανώσει αναδρομικές εκθέσεις των έργων της στην Αθήνα (2002), στο Ρέθυμνο (2005), στο Βερολίνο (2006) και στη Φιλιππούπολη (2010). Η μόνιμη έκθεση των έργων της καθώς και η Συλλογή ελληνικής ναΐφ ζωγραφικής, που διαρκώς εμπλουτίζεται, φιλοξενείται στην Αίθουσα Εκθέσεων και Εκδηλώσεων του Ιδρύματος, όπου διοργανώνονται κι άλλες περιοδικές εκθέσεις. Ενδεικτικά αναφέρουμε:
Έλληνες Ναΐφ Ζωγράφοι
11 Φεβρουαρίου 2013 – 29 Μαρτίου 2013
Ρούλη Μπούα – Μανούσος Χαλκιαδάκης
18 Νοεμβρίου 2015 – 31 Ιανουαρίου 2016
Αποσπάσματα: Δυσδιάκριτες πραγματικότητες στην εφαρμοσμένη αρχαιολογική φωτογραφία
Έκθεση αρχαιολογικής φωτογραφίας του Σωκράτη Μαυρομμάτη
23 Φεβρουαρίου 2017 – 30 Απριλίου 2017
H έκθεση αυτή παρουσιάστηκε και στη Θεσσαλονίκη στο Πολιτιστικό Κέντρο του ΜΙΕΤ (Βίλα Καπαντζή), 7 Δεκεμβρίου 2018 – 27 Ιανουαρίου 2019, στο Ιστορικό και Λαογραφικό Μουσείο Νικήτης, 21 Ιουνίου – 30 Σεπτεμβρίου 2019 και στο Βυζαντινό Μουσείο Ιωαννίνων, 11 Απριλίου – 29 Σεπτεμβρίου 2022 σε συνεργασία με την Εφορεία Αρχαιοτήτων Ιωαννίνων.
Η Συλλογή της Ελληνικής Ναΐφ Ζωγραφικής μαζί με έργα της Έφης Μιχελή έχει ταξιδέψει μέχρι σήμερα στην Ξάνθη ( 2014), Λάρισα (2018), Νικήτη ( 2021) και Θεσσαλονίκη (Βissell Library, Anatolia College 2022).
Νίκη Ελευθεριάδη: Ζωγραφίζοντας πάνω στον πηλό
19 Νοεμβρίου 2019 – 19 Ιανουαρίου 2020
Αναστασία Αρχοντή: Αναδρομική έκθεση
5 Μαΐου – 30 Ιουνίου 2022
Μνήμες του δρόμου: Η διαδήλωση ως πολιτισμική παραγωγή μέσα από τις φωτογραφίες του αρχείου Serge Collet
(σε συνεργασία με το Τμήμα Φιλοσοφικών και Κοινωνικών Σπουδών του Πανεπιστημίου Κρήτης)
23 Νοεμβρίου – 23 Δεκεμβρίου 2022
Στο πλαίσιο της έκθεσης με τίτλο «Τεκμήρια Ελληνικού Πολιτισμού: Η ναΐφ ζωγραφική αγγίζει παραδοσιακά αντικείμενα» που διοργανώθηκε σε συνεργασία με το Λαογραφικό Ιστορικό Μουσείο Λάρισας, σχεδιάστηκε το διαδραστικό εκπαιδευτικό παιχνίδι για μικρούς καλλιτέχνες με πυρήνα τα έργα της Έφης Μιχελή, μία εφαρμογή εμπνευσμένη από τα εκπαιδευτικά προγράμματα του ΛΙΜΛ.
